A pós-graduação em Neurologia tem como objetivo formar especialistas altamente qualificados para atuar no diagnóstico, tratamento e prevenção das doenças neurológicas. Busca-se desenvolver competências clínicas e científicas que permitam ao médico integrar prática assistencial e pesquisa. O curso promove atualização constante diante dos avanços tecnológicos e terapêuticos da área, além de estimular a formação crítica e reflexiva, voltada para a melhoria da qualidade da assistência ao paciente. Também favorece a interdisciplinaridade, aproximando a neurologia de outras especialidades médicas e áreas da saúde. Dessa forma, contribui para o fortalecimento da produção acadêmica e científica, consolidando a instituição como referência em neurologia.
O curso se apresenta estruturado em 3 anos (6 períodos). As atividades práticas hospitalares são sob a supervisão de médicos preceptores. O curso de pós-graduação em Neurologia compreende 15% de sua carga horária em atividades teóricas, sob a forma de aulas teóricas e 85% de práticas realizadas em hospitais, centros médicos conveniados, atividades práticas acadêmicas e atividades práticas em docência.